La séquence de clones MSSA Staphylococcus aureus sensibles à la méthicilline ST a été de plus en plus identifiée comme pathogène dans divers contextes géographiques, mais son épidémiologie reste incomplètement comprise. Dans cette étude cas-témoin des infections à SASM, nous avons identifié ST MSSA comme une communauté importante. pathogène MSSA associé à l’hôpital dans le quartier dominicain du nord de Manhattan

S aureus, MSSA, CC, ST humaine, étude cas-témoinDurant la dernière décennie, des infections à Staphylococcus aureus de type ST ont émergé dans le monde entier Il y a de plus en plus de preuves épidémiologiques et génétiques que S aureus méthicillinorésistant MRSA et S méthicilline Aureus MSSA ST constituent au moins des lignées distinctes cliniquement et biologiquement, MSSA ST étant le précurseur probable du SARM ST Alors que le SARM ST a été associé à une exposition au bétail et est rarement rencontré au-delà des contacts immédiats avec les animaux. Ménages Cependant, l’épidémiologie des infections MSSA ST humaines reste mal décrite. Plus particulièrement, la MSSA ST représentait une proportion élevée des infections à S aureus en Chine et a été décrite dans les infections invasives aux Pays-Bas, en France et aux Etats-Unis [- ] Bien qu’il soit présent comme l’un des clones MSSA infectieux les plus communs dans la région de New York , ST a été absent de Ici, nous avons systématiquement étudié les infections à SASM pour la présence de ST dans un hôpital de soins tertiaires dans le nord de Manhattan pendant une période d’un an. Nous avons ensuite réalisé une étude cas-témoins pour évaluer les données démographiques, cliniques et cliniques moteur. et les facteurs de risque microbiologiques des infections à SASM ST par rapport aux infections à SASM non ST

Méthodes

Entre janvier et janvier, tous les échantillons de SASM disponibles excluant les isolats sanguins cultivés au laboratoire de microbiologie clinique de la CUMC ont été recueillis et testés prospectivement avec une réaction en chaîne par polymérase spécifique à la lignée ST PCR. À l’aide d’un générateur de nombres aléatoires, chaque cas ST a été comparé aux contrôles MSSA de la même collection d’échantillons. Tous les isolats ont été caractérisés par S aureus protéine A en utilisant le logiciel Ridom StaphType et regroupés dans des complexes spa clonaux spa-CCs présence de Panton-Valentine leucocidine PVL comme décrit ailleurs Les types de Spa compatibles avec la lignée ST ont été vérifiés par typage de séquence multilocus Les informations démographiques et cliniques ont été extraites des dossiers médicaux électroniques du patient par revue rétrospective des concentrations minimales inhibitrices antimicrobiens positifs ont été L’expression de la résistance à la clindamycine inductible due au gène erm a été déterminée par le test de Kirby-Bauer . L’analyse univariée a été effectuée en utilisant des tests exacts de Fisher Toutes les variables avec une valeur de P de & lt; Les modèles univariés ont été introduits dans le modèle de régression logistique multivariée initiale. La méthode de sélection par étapes avec entrée et séjour de P = a été utilisée pour construire le modèle de régression logistique multivariée finale. le modèle final a été signalé Toutes les analyses statistiques ont été effectuées à l’aide du logiciel SAS, version SAS Institute, Cary, Caroline du Nord

RÉSULTATS

Nous avons criblé des cultures successives de MSSA non-flux provenant de patients individuels au CUMC avec PCR spécifique à la lignée ST et% d’échantillons positifs identifiés La majorité de ces échantillons étaient de type spa tn = [%], alors que tn = et t t, t, t, et t Ces types de spa ont été vérifiés par typage ST par MLST La plupart des patients avec infections ST vivaient dans le bassin versant de l’hôpital dans le nord de Manhattan n =, dans le Bronx n =, et rarement dans d’autres arrondissements de la ville =, État de New York n =, ou New Jersey n = Remarquablement, près de la moitié des patients n = [%] avaient été admis à l’hôpital dans les mois précédant leur infection ST En outre, les patients% qui ont contracté l’infection au cours de leur séjour hospitalier Dans une étude cas-témoins, nous avons comparé chaque cas ST avec des témoins MSSA non-ST appariés au hasard Tableau Parmi les isolats MSSA témoins, spa-CC t-ST n = [%], spa-CC t-ST n = [% ], spa-CC t-ST n = [%], et spa-CC tn = [%] ont été les plus fréquemment rencontrés

Tableau Caractéristiques de la population de l’étude, selon le cas Cas témoins Cas caractéristiques, Non% n = Contrôles,

Non% n = P Valuea Données démographiques Femme Catégorie d’âge, y & lt; & lt; – – & gt; Hispanique ethnie & lt; Race Asiatique Noir Blanc Inconnu Nord de Manhattan /

Bronx zip code & lt; Comorbidités Diabète sucré Dépendance à l’alcool & lt; Cancer immunosuppresseur

traitement Fibrose kystique Malformation anatomique Maladie cutanée sous-jacente Maladie cardiovasculaire Maladie pulmonaire Maladie rénale terminale

hémodialyse Maladie du foie & lt; Type d’infection Peau et tissus mous

infection Pneumonie Expériences acquises en milieu hospitalier Infections des voies urinaires Infections des voies urinaires Infections des yeux / oreilles Ostéomyélite Infections bactériennes secondaires Colonisation Communauté vs infection hospitalière Admis à l’hôpital de

apparition de l’infection Admis pour le début de l’infection à l’hôpital, & gt; h

Admission à l’hôpital admission

mo & lt; Résident de maison de repos Associé à la communautéb Chirurgie antérieure Infection post-opératoire Infection à l’USI Décès La résistance aux médicaments Pénicilline & lt; Levofloxacine érythromycine & lt; Clindamycine

Kirby-Bauer & lt; Présence de PVL dans la tétracycline Cas caractéristiques, Non% n = Témoins,

Non% n = P Valuea Données démographiques Femme Catégorie d’âge, y & lt; & lt; – – & gt; Hispanique ethnie & lt; Race Asiatique Noir Blanc Inconnu Nord de Manhattan /

Bronx zip code & lt; Comorbidités Diabète sucré Dépendance à l’alcool & lt; Cancer immunosuppresseur

traitement Fibrose kystique Malformation anatomique Maladie cutanée sous-jacente Maladie cardiovasculaire Maladie pulmonaire Maladie rénale terminale

hémodialyse Maladie du foie & lt; Type d’infection Peau et tissus mous

infection Pneumonie Expériences acquises en milieu hospitalier Infections des voies urinaires Infections des voies urinaires Infections des yeux / oreilles Ostéomyélite Infections bactériennes secondaires Colonisation Communauté vs infection hospitalière Admis à l’hôpital de

apparition de l’infection Admis pour le début de l’infection à l’hôpital, & gt; h

Admission à l’hôpital admission

mo & lt; Résident de maison de repos Associé à la communautéb Chirurgie antérieure Infection post-opératoire Infection à l’USI Décès La résistance aux médicaments Pénicilline & lt; Levofloxacine érythromycine & lt; Clindamycine

Kirby-Bauer & lt; PVT présence de tétracycline Abréviations: USI, unité intensive; PVL, Panton-Valentine leukocidina Fisher test exactb Communauté associée définie comme culture positive & lt; La fréquence de la positivité de la PVL était similaire dans les deux groupes. Les isolats de la table ST et de la MSSA témoin étaient très sensibles à la plupart des antimicrobiens testés. Cependant, presque tous les isolats de ST étaient résistants à l’érythromycine. et% de clindamycine comparé à seulement% P & lt; Dans les deux groupes, plus d’hommes que de femmes étaient infectés. Les cas et les témoins différaient selon leur répartition par âge, ethnicité et zone de résidence Comparés aux témoins, les patients ST étaient plus susceptibles – ans% vs%, P =, alors que plus de témoins étaient & lt; ; ans Comparés aux témoins, les patients ST se sont identifiés plus fréquemment comme Hispaniques% vs%; P & lt; et résidait dans la zone entourant l’hôpital% vs%; P = Les cas et les témoins présentaient une prédominance des infections cutanées et des infections des tissus mous, et partageaient des mesures similaires d’hospitalisation et de mortalité. Les cas de ST étaient plus fréquemment associés aux bactériémies secondaires, mais cela n’a pas atteint la signification statistique% vs%, P = Les cas de ST ont été plus fréquemment admis à l’hôpital au cours des mois précédant leur culture positive% vs%, P =, alors que globalement ST et les contrôles étaient fréquemment compatibles avec les infections à S aureus associées à la communauté% vs%, P = Bien que plusieurs prédispositions potentielles Les comorbidités pour les infections à SASM étaient partagées entre les cas et les contrôles comme le diabète sucré, le cancer ou les maladies cutanées sous-jacentes, plus de patients atteints de ST avaient une cirrhose du foie et une dépendance à l’alcool que les témoins. dans le nord de Manhattan / codes postaux du Bronx OU, [% CI, -], origine ethnique hispanique OU, [% CI, -] , l’admission à l’hôpital dans les mois précédant l’infection OU, [% IC, -], et un diagnostic d’abus d’alcool OU, [% IC, -] étaient significativement associés à l’infection ST MSSA

DISCUSSION

Des infections à ST MSSA ont été rencontrées dans le monde entier, mais aux États-Unis, la plupart des cas semblent être limités à New York [,,,] La présente étude examine l’épidémiologie des infections ST non bactériennes dans un hôpital de soins tertiaires du nord de Manhattan. L’ethnie hispanique et la résidence dans le bassin versant de l’hôpital étaient indépendamment associées aux infections ST, ce qui suggère que la communauté colonisée sert de source d’infections. De manière inattendue, les patients atteints d’infections ST étaient aussi plus fréquemment hospitalisés au cours des mois. Avant l’infection Nos résultats suggèrent que ST est devenu un pathogène associé à la communauté et aux hôpitaux. Nous avons noté une tendance à des épisodes plus fréquents de maladie invasive secondaire avec ST, ce qui est cohérent avec une enquête récente sur les infections sanguines françaises. maladie invasive peut indiquer des caractéristiques de virulence non encore identifiées de ST MSSA Alternativel y, il peut également refléter les comorbidités sous-jacentes ou un état immunodéprimé de l’hôte affecté La santé plus faible d’un sous-ensemble de patients ST dans notre population est indirectement suggérée par la proportion plus élevée d’abus d’alcool, de cirrhose et d’hospitalisation récente. l’acquisition de ST MSSA, où les patients ont acquis le clone à l’hôpital et ont ensuite développé une infection dans la communauté Notre étude a démontré que les infections ST étaient fréquentes chez les Hispaniques vivant dans la communauté dominicaine de Washington Heights A ce titre, nous émettons l’hypothèse York par les Dominicains voyageant entre les pays et continuant à se propager dans ce groupe Bien que certaines différences entre les cas et les contrôles puissent être intrinsèques à l’ethnicité, plusieurs patients infectés par ST étaient non hispaniques et résidaient dans d’autres parties de la ville. Ceci suggère une transmission locale ou d’autres réservoirs de STSeveral limitations à notre stu Premièrement, la collecte de données reposait sur un examen rétrospectif des dossiers médicaux, ce qui a pu introduire un biais d’information potentiel. Deuxièmement, l’appariement des cas et des contrôles par des variables telles que l’âge ou le site d’infection aurait pu influencer les résultats. Le groupe était constitué de SASM génétiquement diverses avec des CC-SPA prédominantes, ce qui pourrait avoir biaisé les comparaisons. Enfin, cette étude représente l’expérience d’un seul hôpital de soins tertiaires et peut ne pas être généralisée à d’autres contextes. ST associée, cette souche a été remarquablement absente des grandes collections d’échantillons de la MSSA européenne et américaine des s et des s [,,,] Ces études ne fournissent probablement qu’une image incomplète de l’épidémiologie moléculaire globale des infections à SASM. plaider en faveur d’une dissémination clonale plus récente de ST Nous supposons que cela pourrait être dû en partie à la La clindamycine fait partie de la couverture empirique de la SARM communautaire chez les patients ambulatoires, en particulier les enfants, avec SSTITaken ensemble, nous avons observé que la SASM ST est une cause fréquente de la communauté et hospitalo-associée de résistance à l’érythromycine et à la clindamycine. Infections à SASM dans le nord de Manhattan Les prédicteurs cliniques des infections ST étaient principalement associés aux personnes vivant dans le quartier largement dominicain entourant l’hôpital. La fréquence étonnamment élevée des contacts récents avec les patients ST souligne l’importance des colonisateurs communautaires comme réservoirs potentiels pour les agents pathogènes nosocomiaux. souligne l’utilité des programmes de surveillance de la MSSA, plutôt que les efforts visant uniquement à surveiller le SARM, étant donné que la MSSA continue de représenter la majorité des infections à S aureus dans le monde

Remarques

Remerciements Nous remercions le laboratoire de microbiologie clinique et Malcolm Rothman pour la collecte de spécimens de Staphylococcus aureus sensibles à la méthicilline. Soutien financier Cette recherche a été soutenue par les Instituts nationaux de la Santé K AI à AC U et R AI et R AI-S à FDL et par Paul A Marks Scholarship to AC Conflits d’intérêts potentiels Tous les auteurs: Aucun conflit signalé Tous les auteurs ont soumis le formulaire ICMJE pour la divulgation des conflits d’intérêts potentiels Conflits que les éditeurs considèrent pertinents pour le contenu du manuscrit ont été divulgués